A crise das vocações religiosas e sacerdotais que afecta a Europa nas últimas décadas do último milénio leva também à redução das Doutrinárias: as escolas de Varallo Sesia, Borgosesia, Sanremo e Vigevano estão fechadas, a presença em Itália, separada da realidade das Edizioni Doutrinárias, centra-se no apostolado paroquial.
O Capítulo Geral de 1994 define o encerramento das Províncias Romana e Piemontesa e dá vida à única Província Italiana, que inclui também a comunidade de Cavaillon-Cheval Blanc.
No dia 9 de julho de 1997, o Capítulo Provincial Italiano, sob a orientação do Padre Luciano Mascarin, Superior Piemontês, aprovou uma “Moção” sobre a missão ad gentes que diz: «O Capítulo é de opinião que a iniciativa missionária, desejada e apoiada pelo último Capítulo Geral, acompanhado pessoalmente pelo Superior Geral, deve continuar”.
Em 2006 começou a presença no Burundi, em Bujumbura. O Padre Luciano Mascarin, depois de doze anos de serviço como Superior Geral, durante os quais acompanhou pessoalmente os contactos com os bispos do Burundi e iniciou estas experiências missionárias, com grande generosidade, coloca-se à disposição, juntamente com o primeiro religioso do Burundi, Venant Ntahonkirije, Nicolas Banikwa, Charles Bitariho e Joseph Mpitabavuma, para iniciar a presença dos Doutrinários no Burundi. Os Padres, além da casa de formação, aceitam a realização de atividades pastorais num bairro periférico de Bujumbura, Ruziba.
No Burundi, hoje, além da casa do Noviciado e do Estudantado Teológico, os padres dedicam-se ao ministério sacerdotal e à pregação e o bispo confiou-lhes paróquias. Foi confiado aos Doutrinários do Burundi em 3 de setembro de 2024 pelo bispo Mons. Severine Niwemugizi da paróquia de Nossa Senhora de Lourdes em Katoke, Biharamulo, diocese de Rulenge-Ngara, Tanzânia. Na fronteira com o Burundi.